La situación presupuestal preliminar del CENAPRED correspondiente al 2003 (antes del cierre para informar la Cuenta Pública de la SEGOB), es la siguiente: Le fue asignado originalmente al Centro, un presupuesto del orden de 42.2 millones de pesos, mismo que por instrucciones de la Secretaría de Hacienda y Crédito Público fue reducido a 38.8 millones de pesos, asimismo fueron centralizados recursos del orden de 2.6 millones de pesos que corresponden a las partidas coordinadas y centralizadas, y se pusieron a disposición de la Dirección General de Programación y Presupuesto recursos aproximados de 1.4 millones de pesos, quedando un presupuesto modificado del orden de 34.8 millones de pesos, con la siguiente distribución a nivel capitulo del gasto:
El Centro llevo a cabo en el transcurso del ejercicio, una serie de proyectos en materia de investigación sobre prevención y mitigación del riesgo de desastres de fenómenos naturales, instrumentación de tecnologías para el monitoreo de dichos fenómenos naturales, difusión de materiales alusivos a la prevención de desastres, capacitación en materia de protección civil y del Programa de Emergencias Radiológicas Externas, y se avanzo en los trabajos del proyecto "Atlas Nacional de Riesgos", de tal forma que el presupuesto fue distribuido a nivel de Proceso y/o Proyecto de la siguiente manera:
El ejercicio del presupuesto por parte de la Dirección de Administración del Centro, fue ejercido en apego a la normatividad vigente, llevándose un control a través del Sistema Presupuestal del CENAPRED (configurado en Acces), que permite obtener información fehaciente y oportuna a nivel de Proceso y/o Proyecto, por área del Centro, Cuenta por Liquidar Certificada (CLC), partida presupuestal, documento de corresponsabilidad, registro y control (DOCORECO), así como modalidades de pago (cheque, pago a proveedor, pedido, etc.).
Otro aspecto importante es que se realizaron cambios administrativos internos que permitieron adaptarse a los cambios realizados en las áreas de la Oficialía Mayor, proporcionando un mejor servicio a las áreas que conforman el Centro, situación que permitió, por una parte el cumplimiento de metas, así como la atención de las solicitudes de apoyo recibidas.
Lo anterior dio como resultado, que al cierre preliminar se tenga un presupuesto ejercido de 31.6 millones de pesos, que representen el 90.1% del presupuesto modificado, quedando un presupuesto comprometido de 3.2 millones de pesos, esto es el 9% del presupuesto modificado, tal como se muestra en la siguiente gráfica: